לא מבצעים.
פשוט לא צריך. בלי להכנס יותר מדי להסברים טכניים, פשוט נאמר שמערכות הקבצים של לינוקס מאכסנות קבצים בצורה כזאת שהם תמיד לא ישברו, כך שאין צורך להריץ איחוי דיסק. היתה פעם תוכנה בשם defrag שהיתה אמורה לאחות קבצים על מערכות קבצים מסוג ext2, אבל הפיתוח שלה נזנח לפני יותר משלוש שנים - היא פשוט מיותרת.