איך מזהים רטרו-וירוסים בגנום ?

[דניאל 2012]

איך מזהים רטרו-וירוסים בגנום ?

שלום לכולם,

מסרטונים שראיתי בנושא אבולוציה הבנתי שאחת העדויות החזקות ביותר לאבולוציה כיום אלו "רטרו-וירוסים" שהגנום שלהם הוטמע בתוך הגנום של בעל החיים שנשא אותם בעבר (ועברו בהמשך לכל צאצאיו).

מה שלא הצלחתי להבין זה איך יודעים שקטע קוד מסויים בגנום הוא רטרו-וירוס ? איך יודעים שזה לא סתם "זבל גנטי" חסר תפקיד כמו רוב הגנום שלנו ? (כך לפחות הבנתי) איך יודעים לזהות שחתיכת קוד מסויימת בגנום התקיימה בעבר כיישות ביולוגית נפרדת בפני עצמה?

שאלה נוספת שרציתי לשאול, מדוע מתייחסים לכרומוזום המאוחה (שני הכרומוזומים של השימפנזים שהתאחו אצלנו לכרומוזום אחד) כהוכחה חותכת לכך שלנו ולשימפנזים היה בעבר אב קדמון משותף? הרי גם אם נניח לרגע שאנחנו והשימפנזים שני ענפים אבולוציונים נפרדים לגמרי (ללא אב משותף) עדיין יכל היה להתרחש אצלנו האיחוד של הכרומוזומים, לא ?

 

[gadallmighty]

על רגל אחת:

1. אם נדמה את רצף הנוקלאוטידים לשפה מדוברת אז רצף של רטרו-וירוס יהיה עם מבטא.
א. בזן מסויים ישנו שימוש ביחס מסוים בין הנוקלאוטידים (G-C, A-T) אצל הרטרו-וירוס היחס אחר,
זה לא מספיק לקביעה אבל זה מעורר עניין להמשך בדיקה.
ב. אם תבדוק את טבלת הקידוד מנוקלאוטידים לחומצות אמינו תראה שישנן חומצות אמינו בעלות יותר מקוד אחד,
אצל הזן המסוים יהיה שימוש בקודים כאלו ואצל הרטרו-וירוס יהיה שימוש בקודים אחרים, זו כבר עדות חזקה יותר.

2.המקרה הנ"ל הוא אפשרות הפרכה לקשר בין האדם לשימפנזה שלא התממשה.
הסברה היא שלאדם ולשיפנזה היה אב קדמון משותף מהתקופה הלא מאוד רחוקה,
ומכך יש להסיק שיהיה דמיון רב בין הגנומים של יצורים אלו כיום.
שינוי במספר הכרומוזומים היה יכול עדות לאי נכנותה של הסברה הנ"ל, אם הדמיון בין הגנומים היה נמוך מידיי
החשיבות היא לא באיחוי של כרומוזומים אלא בכך שהמידע הגנטי נשמר (גם אם באופן ארגון אחר)
ושבבדיקה מדוקדקת יותר התברר שהדמיון הגנטי שבאדם ובשימפנזה הוא אכן גבוה מאוד.

* השימוש במונחים כמו "העדויות החזקות ביותר" או "כהוכחה חותכת" לא מתאים לדעתי,
מדובר בעדויות תומכות המתווספות לשלל אחרות שכולן יחד מובילות אל נכונות תיאורית האבולוציה.