באופן עקרוני לא.
אם ההשוואה היא בין כרטיס גינרי לבין כניסה על לוח האם - אין שום הבדל משמעותי - הבסיס לשתי הכניסות הינו chipset-ים של יצרנים מסויימים ואין זה משנה האם הוא נמצא על כרטיס PCI או על לוח האם. במקרה כזה, אגב, עדיפה כניסה על לוח האם משום שתופסים פחות PCI SLOT.
