אתה שואל על מערכת החיסון הבקטריאלית או הכלי שפותח ממנה
הguide RNA במערכת הסינטתית הוא קטע של 50 או 100 בסיסים (אני כבר לא זוכרת), שמתוכם חלק של כ20 בסיסים מהווה רצף הכרה לגנום (כלומר קומפלמנטרי לקטע בגנום) ושאר הרצף מתקפל ליצירת אתר הכרות לחלבון CAS9. ככה הגאייד מאפשר לחלבון להכיר את האזור הספציפי בגנום שצריך לחתוך.
 
אני חושבת שההסברים הסכמטיים הבסיסיים הכי ברורים נמצאים דווקא באתר של addgene