הגדרת החיים
שני מאפיינים חשובים של חיים הם רבייה והשרדות. אבל נעשה הפסקה קצרה ונחזור לזה אחר כך. בגדול קיימות שתי אסטרטגיות של מהלך חיים ותחום אפור ביניהן. אני מתכוון לאסטרטגיית חיים מסוג K לעומת r. אלה של סוג K הם בעלי חיים גדולים שמשום תחרות עזה על משאבים, נדרש להם זמן רב יותר לאסוף משאבים כדי להגיע לשלב רבייה. עיקר המאמץ שלהם הוא בהשרדות. K כולל בעיקר עופות ויונקים. יש השגחה הורית ומספר צאצאיהם נמוך. באסטרטגיית r לעומת זאת, המצב הפוך: צאצאים רבים, אין השגחה הורית, בעלי חיים קטנים, בגרות מינית בגיל צעיר ועיקר המאמץ הוא ברבייה ולא בהשרדות. דוגמאות בעיקר מחסרי חוליות, ממלכת הצומח, וכל יתר המחלקות הפויקילותרמיות (דגים, דו-חיים, זוחלים). עצים חיים זמן רב, אבל הם בעלי צאצאים קטנים ורבים. הצב הוא זוחל שחי זמן רב ובתנין יש השגחה הורית. בקוקיה בניגוד לכך אין השגחה הורית. תחום אפור. האם בעלי חיים מתרבים כדי להעביר הגנים שלהם? כן, אבל זו בסך הכל דרך להתגבר על בלאי החומר (הגנטי). זוהי גם דרך להתמודד עם תנאי סביבה משתנים. הגנים אינם בהכרח יחידת הסלקציה. גם גנים עוברים שינויים ברצף ולו משום שהגדיל של הדנ"א יהיה פחות מסולסל וקל לקריאה ושכפול. כלומר, הגדיל עצמו נתון לסלקציה וחלק מהבעיות בביומכניקה שלו נפתרות על ידי שינוי רצפים של גנים. תחשבו על זה, גנים שמשמשים בו זמנית גם ליצירת חלבונים ברמה התאית וגם כדי לייצב את גדיל הדנ"א באופן הטוב ביותר. אם זו לא חסכנות, אז אני לא יודע מה כן... האם רבייה היא עוד תכונה המגבירה כשירות או החלק השני בהגדרה של חיים? לכאורה, בתנאים קבועים, אין צורך לשנות את הרצף הגנטי. אולי מירוץ חימוש אבולוציוני מול מתחרים עשוי לשנות אותו, אבל תורת המשחקים האבולוציוניים טוענת שבמצב יציב אף אחד מהשחקנים לא ישנה את עמדתו, אז גם זה יורד. עותקים של גנים מסויימים חשובים יותר ואחרים חשובים פחות. גנים השייכים למשפחת ה- house keeping הם גנים שמרנים יותר ולא ישתנו. גנים המגדירים פעילות נוספת של התא בעלי סיכוי גדול יותר להשתנות. בנוסף, ככל שגן הוא עתיק יותר פחות סביר שהוא ישתנה. גנים עתיקים כמו זה של ציטוכרום p450 הם עתיקים דיים כך שהשינויים בהם מינוריים ומשתמשים ברצפים שלהם כדי לבנות עצים פילוגנטיים. כשרוצים לבדוק שינויים קטנים יותר (למשל בין שני מינים מאותו סוג) משתמשים בגנים 'חדשים' יותר שעברו יותר שינויים. גנים עתיקים יכולים להיות גם שרידים אבולוציוניים, כך שלמרות שיעילותם בהתאמה לתנאים של היום נמוכה, כיוון שעל גביהם נבנו תכונות הכרחיות לקיום האורגניזם היום, תכונות אלה ישארו.
