אבולוציה מתכנסת ברמת אורגניזם
לא תמיד גוררת בהכרח מערך גנטי שונה. למשל אפשר להניח שמחזורי הרביה של הציקדות מונעים על ידי הורמוני מין מסויימים. סביר להניח שיש הומולוגיה בין הורמוני המין (סקס) של מין (ספישי) ציקדות אחד למין שני. אבל מה שקורה זה שהמחזוריות שלהם מקבלת דפוס דומה באופן נפרד זה מזה, ולא מדובר בתהליך שקרה פעם אחת באב קדמון ועבר לכל הצאצאים. אני מניחה שבדוגמת הציקדות משערים שמדובר באבולוציה מתכנסת ולא באב קדמון, משום שיותר סביר שהמין (ספישי) כולו הוא עתיק יותר מהתכונה, מאשר שהתכונה עצמה קדומה יותר מהמינים השונים (דבר שידרוש בעצם את אותו התהליך האבולוציוני המלא בדיוק מוחלט פעמיים). גם בדוגמת הגפיים שהציגו- כנפי עטלף וכנפי עופות, למעשה יש הומולוגיה מאוד גדולה. הגפיים של כל החולייתנים הומולוגים ואותם מערכי גנים (לפחות הרגולטוריים בתחילת התהליך) פעילים ביצירת הגפיים. אבל מדובר באבולוציה מתכנסת משום שהכנפיים התפתחו פעמיים באופן בלתי תלוי (עטלפים הם לא צאצאים של עופות, וגם לא של הדינוזאור שהוא האב הקדמון של עופות). לעומת זאת ביצירת הכנפיים אצל חרקים המערך הגנטי כבר שונה יותר- עדיין קיים דימיון גנטי כלשהו אבל קטן יותר. יש כמה גנים רגולטוריים שמורים מאוד אבולוציונית שפעילים בדי הרבה מהשלבים ההתפתחותיים שלנו, ובהתפתחות של איברים שאין בינהם קשר ממשי. סביר יותר להניח שגן שכבר קיים יקבל פעילות נוספת שתיצור מודיפיקציה חדשה מאשר שיווצר גן חדש וזר לחלוטין. לכן אני לא בטוחה כמה הבדל קיים במערכים גנטיים שלמים כאשר מדובר באבולוציה מתכנסת.
לא תמיד גוררת בהכרח מערך גנטי שונה. למשל אפשר להניח שמחזורי הרביה של הציקדות מונעים על ידי הורמוני מין מסויימים. סביר להניח שיש הומולוגיה בין הורמוני המין (סקס) של מין (ספישי) ציקדות אחד למין שני. אבל מה שקורה זה שהמחזוריות שלהם מקבלת דפוס דומה באופן נפרד זה מזה, ולא מדובר בתהליך שקרה פעם אחת באב קדמון ועבר לכל הצאצאים. אני מניחה שבדוגמת הציקדות משערים שמדובר באבולוציה מתכנסת ולא באב קדמון, משום שיותר סביר שהמין (ספישי) כולו הוא עתיק יותר מהתכונה, מאשר שהתכונה עצמה קדומה יותר מהמינים השונים (דבר שידרוש בעצם את אותו התהליך האבולוציוני המלא בדיוק מוחלט פעמיים). גם בדוגמת הגפיים שהציגו- כנפי עטלף וכנפי עופות, למעשה יש הומולוגיה מאוד גדולה. הגפיים של כל החולייתנים הומולוגים ואותם מערכי גנים (לפחות הרגולטוריים בתחילת התהליך) פעילים ביצירת הגפיים. אבל מדובר באבולוציה מתכנסת משום שהכנפיים התפתחו פעמיים באופן בלתי תלוי (עטלפים הם לא צאצאים של עופות, וגם לא של הדינוזאור שהוא האב הקדמון של עופות). לעומת זאת ביצירת הכנפיים אצל חרקים המערך הגנטי כבר שונה יותר- עדיין קיים דימיון גנטי כלשהו אבל קטן יותר. יש כמה גנים רגולטוריים שמורים מאוד אבולוציונית שפעילים בדי הרבה מהשלבים ההתפתחותיים שלנו, ובהתפתחות של איברים שאין בינהם קשר ממשי. סביר יותר להניח שגן שכבר קיים יקבל פעילות נוספת שתיצור מודיפיקציה חדשה מאשר שיווצר גן חדש וזר לחלוטין. לכן אני לא בטוחה כמה הבדל קיים במערכים גנטיים שלמים כאשר מדובר באבולוציה מתכנסת.