פרויקט הגנום האנושי - חלק 2 : Microbiome

[Escherichia Coli]

../images/Emo32.gifפרויקט הגנום האנושי - חלק 2 : Microbiome

הגוף האנושי מורכב למעשה מבליל של גנומים בקטריאלים\מיקרוביאלים וגנומים "אנושיים נטו" - אם ניתן דוגמה מפורסמת ויוקרתית אחת - חיידק המעיים החביב ועבדכם הנאמן הוא רק דוגמה אחת לכמות הרבה של "גנום זר" המצוי בגופנו. טוב, הדבר הזה הוא לא בדיוק חדשות, אבל גם לא היסטוריה עתיקה - אבל מסתבר שהמיפוי של הגנום "האנושי" נמשך - רק הפעם (מדובר במשהו מהקיץ של שנה שעברה) - מדובר על מיפוי הMicrobiome - שהוא למעשה מכלול הגנומים ה"לא אנושיים" הקיימים בתוך האורגניזם האנושי. אין ספק שלאורך מיליוני השנים בהם הגנומים האנושיים (ושל אבותינו הקדמונים) והגנומיים המיקרוביאלים חיו בסימביוזה\סימפטריה - פיתחנו, אם לא תלות אז בטח שסוג של יחסי גומלין "אחד עם השני" (אנחנו הרי פחות או יותר חלק מאותה סופר-מושבה גדולה) הבנת האינטראקציות בין דיירנו הפנימיים והגנום האנושי שכבר מופה וודאי תסייע רבות למדע הרפואה ולהבנתנו של המכונה הביולוגית הנקראת Homo sapiens. אז, on the top of my head - איך המיפוי של המיקרוביום יכול מעניין ו\או מועיל עבורנו? קודם כל - הרבה פעמים כשלוקחים אנטיביוטיקה, אז, מה לעשות, יש overkill - ואנחנו הורגים גם את ה"חיידקים הטובים" שלנו - פיצוח המיקרוביום יפתור את הבעיה הזו, משום שנוכל לתכנן תרופות אנטיביוטיות שלא ישמידו את "החיידקים הטובים" עם "החיידקים הרעים" וכמו כן - יש גם את האופציה הפרקטית (ראו לינקים למטה) לווסת את ריכוז המיקרובים ברקמות מסוימות במצב שבו פתולוגיה מסוימת נובעת מחוסר\עודף של מיקרובים "מועילים". לקריאה נוספת: 1.הפוסט בזמנו מביוסינגולרטי 2.פוסט של הביולוג האבולוציוני Jonathan A. Eisen בבלוג Tree of Life (הוא משתתף בסדנה הממומנת ע"י ה-NIH העוסקת במיקרוביום)

 

[Wolverchenus]

זה מגניב ../images/Emo45.gif

מעבר לעובדה שזה מגניב כי זה מראה לנו ממה אנחנו מורכבים בין השאר, זה מגניב כי יש מחלות ספציפיות שנובעות מזה שדברים מהאקולוגיה המיקרוביולוגית של בנאדם אחד (סתם דברים שחיים לו על האור) רעילים לפעמים לאנשים אחרים. למשל בדברים כמו מחלת הסבוריאה (רגישות לשמר מסוים).. טוב זה פשוט מגניב!

 

[Escherichia Coli]

השמר נחשב לפתוגן?

או שפשוט יש אנשים שנולדים "בלי זה"? זה מאוד מוזר (אני לא יודע איך להתייחס לזה - משום שזה וודאי לא משהו שעובר בגנטיקה - אולי ה*עמידות* לזה כן, אבל מאחר וזה משהו חיצוני - אז זה גם מאוד תלוי סביבה :-| אם אתה מכיר את השם של זה באנגלית, אני אשמח.

 

[Wolverchenus]

seborrea

 

[blueshark09]

ha

 

[blueshark09]

ישנם גם המון אורגניזמים שהם פרזיטים "שקטים",

דוגמת וירוסי הרפס למיניהם שלרב חיים בלי להתפרץ במשך רב חיינו ב90% מהאוכלוסיה יש הרבה אורגניזמים ויראליים , בקטריאליים , פונגאליים שנמצאים בתוכנו כפרזיטים שלא גורמים נזק - חלקם אפילו עלולים להכיל תכונות סימביונטיות, אך עם זאת יש בני אדם שלא מתאימים איתם (ממש כמו גן ואנטיגן) ובהם יש התפרצות מחלה. אין ספק שלאורך התהוות הגנומים של אויקיריה מפותחים כמונו היתה מיגרציה של DNA ויראלי ואפילו בקטריאלי בתוך מערכת ענקית כזו ולפיכך אבולוציה מואצת משותפת. אנחנו יודעים למשל שיש אורגניזמים ויראליים שגורמים לסרטן על ידי שילוב לתוך הגנום האנושי, באותה המידה יש כאלה שלא גורמים נזק ישיר, אך גורמים להעשרת ושחלוף הקוד. במילה אחת - מדהים !

 

[Escherichia Coli]

וירוסים סימביונטיים?? אתה יכול לתת דוגמה?

 

[blueshark09]

מפה עד הודעה חדשה

כל הרקמות שלך שורצות בוירוסים למיניהם, כפי שכבר השוואתי בין אוכלסויות פרוקריה ואורגניזם אויקריוטי תחשוב על הדוגמא הבא מעולם הפרוקריה למשל - כמחצית (!) מהבקטריות בתוך האוקיאנוסים גומרות את המחזור חייהן כקורבן לפאג'ים. דוגמא אחת טובה היא הצינון - לרב אנחנו נדבקים כמובן בוירוס מאדם אחר, אך מקורו במוטציה באוכלוסיה ויראלית של אחד הפרטים האנושיים שנושאים אותו. בעצם רבנו חיים עם לא מעט וירוסים ואלה יכולים להשתלט כאשר האורגניזם נחלש ("התקררנו"). לגבי הרפס כבר אמרתי ? לא מהעולם האנושי - דוגמא למשו שחשוד כסימביוזה בין אויקריה לוירוס לצרכי תקיפה אלימה : http://www.thefreelibrary.com/Poisonous+partnership:+parasitoid+wasps+use+viruses+as+a+weapon-a0130282942

 

[Escherichia Coli]

הממ, אז אתה לא מכיר וירוסים

שנמצאים איתנו ביחסי סימביוזה קבועים? זה נשמע פשוט קצת מוזר עבור וירוס - שכל כך תלוי בנו בשביל השכפול שלו - זה הגיוני עבור בקטריה.. אבל הם מסתדרים בעצמם מהבחינה הזו. הדוגמה שהבאת מגניבה לגמרי, אגב!

 

[Wolverchenus]

רגע שאני אבין,

תמיד חשבתי ש"התקררנו" זה בעצם אומר "נדבקנו בוירוס". אתה אומר לי שבאמת מקבלים קירור כי נחלשים ושהוירוס שם מלכתחילה ושאנחנו במאבק תמידי איתו?

 

[angela8]

זה לא קשור לחוזק המערכת החיסונית?

 

[blueshark09]

ברב המקרים נדבקים בוירוס ממישהו אחר

ולרב אפילו חולים דיי בסמיכות למועד ההדבקות בצורה זו או אחרת. לעיתים קרובות מאוד ה"מחלה" עובדת מבלי שאנו בכלל נבחין במתרחש במערכת החיסונית שלנו, אלא אם כן אנחנו "נתפסים" חלשים ואז הפרזיט חוגג. הרבה וירוסים גם בעלי תקופת אינקובציה - הם חיים איתנו ומחכים להזדמנות להתפרץ. זה בדיוק המקרה עליו אתה שאלת - הוירוס יושב אצלנו באינקובציה ומחכה להתפרצות, הוא בעצם "עובד" על המערכת החיסונית ומסתתר עד אשר תהיה הזדמנות. התקררת ? בום ! הוירוס שנדבקת בו לפני שבוע עושה עליך חפלה.

 

[רוקד עם שבלולים]

on the top of your head

תחבוש כובע כשיש שמש. האופציות שהצעת OFF the top of your head גם הן לא הכי פרקטיות. מכל ההכרזות שביולוגים אוהבים להכריז על "מטרות חדשות לחומרים אנטיביוטיים" בינתיים אף תרופה לא יוצאת לשוק כבר שנים רבות, בטח לא משהו שספציפי לחיידק מסויים. זה טוב בשביל להרשים את הציבור ולקבל מענקי-מחקר. בתכל'ס, ממפים את המיקרביום כי רוצים לדעת מה יש שם בפנים. גם יהיה מאד מאד קשה להבדיל בין חיידק טוב ורע. בהרבה מקרים זה אותו חיידק, רק בנסיבות אחרות. מי שרוצה להמשיל את זה לפוליטיקה ולבני-אדם מוזמן לעשות זאת על אחריותו. אנחנו תלויים בחיידקים שלנו. מי שלקח פעם הרבה אנטיביוטיקה בוודאי זוכר את השילשולים, שהם תוצאה ישירה של זה שהאנטיביוטיקה הרגה את חיידקי המעיים שלו. זו לא דוגמא יחידה. אגב, אוכלי-עשב (פרות, כבשים...) לא באמת יכולים לעכל עשב. יש להם חיידקים מיוחדים עם צלולאזות (אנזימים מפרקי-תאית) שעשוים עבורם את העבודה.

 

[Wolverchenus]

היה יכול להיות נורא מגניב

להשיג חיידקי קיבה של אוכלי עשב ופשוט לשבת בגינה כל היום ולנשנש.

 

[Escherichia Coli]

זה היה גם נורא מגניב למות מהמחלות שהם

היו עושים לך

 

[רוקד עם שבלולים]

נו, באמת

כל חיידק פתאום נהיה פתוגן? מה זה הגזענות הזו,קולי? ממך ציפיתי ליותר. הבעיות שמונעות מאיתנו להנדס אכילת עשב: א) צריך גם תשתית. אתה רוצה שישתילו לך ארבע קיבות? אז זהו. ב) עשב זה לא טעים. לא סתם היחידים שאוכלים עשב הם יצורים מאד טיפשים. (והרחבה - בספטמבר '08)

 

[Escherichia Coli]

ספטמבר 8, עוד 9 חודשים למניאק?

לא רוצים לוף, רוצים דנונה, עד מתי ספטמבר שמונה

וכן, אני גזען מיקרובים! סתם, האמת שאין לי מושג איזה חיידקים יש בקיבה של הפרות - ואין לי מושג אם החיידקים האלה יהיו מלאדפטיביים אצלנו. (או מועילים)

 

[Escherichia Coli]

קיבלתי את התיקון :-|

אממ, חבל לי לגלות שבעצם זה הכל קונספירציה של מדענים שצריכים לעבוד על הציבור כדי לקבל מענקי מחקר.. אתה אומר שאין שום אפשרות לנצל את הנתונים האלה כדי לבצע מניפולציות בחברינו הפנימיים?

 

[רוקד עם שבלולים]

never say never

לא אמרתי שאין השלכות שימושיות. אמרתי ש"אנטיביטיקה חדשה" זה סוג של אמריה ששקול ל"תנו לנו לחטט ונראה מה יהיה". בטוח ימצאו שם משהו מעניין. מה זה יהיה - את זה כבר לא יודעים. כללית, המשחק במדע הולך כך: המדען רוצה לחקור מה שבא לו. האנשים עם הכסף (ממשלתי, פרטי לא חשוב) רוצים מוצרים ותועלת. המדען עושה כאילו הוא הולך לחפש את זה, אבל בתכל'ס עושה מה שמעניין אותו. בסופו של דבר התוצאות והתועלת מגיעות ממקומות בלתי-צפויים לחלוטין, וכולם שמחים.

 

[Escherichia Coli]

ארמ ומה אם לא? ../images/Emo2.gif

זה יכול להיות מאוד מביך!