זקוק לעזרתכם.

א

אני רק עובר

New member
והנה משהו יותר רלוונטי וגם די מעניין

http://www.nature.com/nature/journal/v443/n7108/full/nature05113.html ע"מ להסביר את מה שהופך אותנו לאנושיים, קבוצת חוקרים חיפשה באופן ספציפי, בתוך ה- DNA הלא מקודד, אחרי הרצף שהכי שונה בינינו לשימפנזים יחסית לחולייתנים אחרים. הרצף הכי שונה שהם מצאו נקרא HAR1. להלן ציטוט מתוך המאמר: The 118-bp HAR1 region showed the most dramatically accelerated change (FDR-adjusted P < 0.0005), with an estimated 18 substitutions in the human lineage since the human–chimpanzee ancestor, compared with the expected 0.27 substitutions on the basis of the slow rate of change in this region in other amniotes. Only two bases (out of 118) are changed between chimpanzee and chicken, indicating that the region was present and functional in our ancestor at least 310 million years (Myr) ago. No orthologue of HAR1 was detected in the frog (Xenopus tropicalis), any of the available fish genomes (zebrafish, Takifugu and Tetraodon), or in any invertebrate lineage, indicating that it originated no more than about 400 Myr ago. No paralogues were detected in any amniote genome draft. Resequencing in four primates further confirms that all 18 substitutions are very likely to have occurred in the human lineage . Checking against available single nucleotide polymorphisms (SNPs; http://www.ncbi.nlm.nih.gov/SNP/)18 and resequencing this region in a 24-person diversity panel19 indicates that all 18 substitutions are fixed in the human population. Evidence from preliminary resequencing of a 6-kilobase (kb) region containing HAR1 shows levels of polymorphism and a positive skew in the frequency spectrum that are typical of European samples20, suggesting that a recent selective sweep in this region of the genome is unlikely . Thus, the changes in HAR1 clearly occurred on the human lineage, but probably took place more than 1 Myr ago כלומר, אפילו אם מחפשים בכל הכוח, אי אפשר למצוא רצף לא מקודד שיותר שונה בינינו והשימפנזים מאשר בינינו והכרישים. לכל היותר ניתן למצוא רצף (וגם הוא של 118 בסיסים בלבד) אשר יותר שונה בינינו ובין השימפנזים מאשר בין השימפנזים ובין התרנגולת, והרצף הזה לא קיים בכלל בדגים.
 
S

SilentMike

New member
הצמדה לשמאל.

http://www.nature.com/nature/journal/v443/n7108/full/nature05113.html ע"מ להסביר את מה שהופך אותנו לאנושיים, קבוצת חוקרים חיפשה באופן ספציפי, בתוך ה- DNA הלא מקודד, אחרי הרצף שהכי שונה בינינו לשימפנזים יחסית לחולייתנים אחרים. הרצף הכי שונה שהם מצאו נקרא HAR1. להלן ציטוט מתוך המאמר: The 118-bp HAR1 region showed the most dramatically accelerated change (FDR-adjusted P < 0.0005), with an estimated 18 substitutions in the human lineage since the human–chimpanzee ancestor, compared with the expected 0.27 substitutions on the basis of the slow rate of change in this region in other amniotes. Only two bases (out of 118) are changed between chimpanzee and chicken, indicating that the region was present and functional in our ancestor at least 310 million years (Myr) ago. No orthologue of HAR1 was detected in the frog (Xenopus tropicalis), any of the available fish genomes (zebrafish, Takifugu and Tetraodon), or in any invertebrate lineage, indicating that it originated no more than about 400 Myr ago. No paralogues were detected in any amniote genome draft. Resequencing in four primates further confirms that all 18 substitutions are very likely to have occurred in the human lineage . Checking against available single nucleotide polymorphisms (SNPs; http://www.ncbi.nlm.nih.gov/SNP/)18 and resequencing this region in a 24-person diversity panel19 indicates that all 18 substitutions are fixed in the human population. Evidence from preliminary resequencing of a 6-kilobase (kb) region containing HAR1 shows levels of polymorphism and a positive skew in the frequency spectrum that are typical of European samples20, suggesting that a recent selective sweep in this region of the genome is unlikely . Thus, the changes in HAR1 clearly occurred on the human lineage, but probably took place more than 1 Myr ago​
כלומר, אפילו אם מחפשים בכל הכוח, אי אפשר למצוא רצף לא מקודד שיותר שונה בינינו והשימפנזים מאשר בינינו והכרישים. לכל היותר ניתן למצוא רצף (וגם הוא של 118 בסיסים בלבד) אשר יותר שונה בינינו ובין השימפנזים מאשר בין השימפנזים ובין התרנגולת, והרצף הזה לא קיים בכלל בדגים.
 
S

SilentMike

New member
הצמדה לשמאל.

(לא הצלחתי למצוא איך מיישרים לימין) נראה שהאזורים הלא מקודדים אצל אדם יותר דומים לאלו של הכריש מאשר לאלו של דגי-גרם (טליאוסטים), למרות שלטענת המאמר הפיצול שלנו מהכריש אירע יותר מוקדם מאשר הפיצול שלנו מדגי-גרם. זה אכן בעיה מסויימת לתיאורית האבולוציה אבל לא ממש חמורה כי ניתן פשוט להסביר את זה בשינוי מהיר ספציפי אצל דגי הגרם. מקובל שדגי הגרם המודרנים הם קבוצה שהתפתחה מהר בעשרות מיליוני השנים האחרונות בעוד שהכרישים הם קבוצה מאוד שמרנית (לא סתם טורחים ללמד אנטומיה של חולייתנים על כרישים למרות שהיה יכול להיות הרבה פשוט וזול לנתח איזה קרפיון). את זה ניתן ליישב ע"י מחקר של אותם רצפים בחולייתנים נוספים, ואנחנו מצפים לראות שדגי הגרם יהיו יוצאי הדופן בזמן ששאר הקבוצות כן תסתדרנה עפ"י העץ האבולוציוני. בכל מקרה אין כאן שום תזכורת לשימפנזים. קוריוז נחמד: המחקר הזה נערך בחלקו במרכז של קרייג וונטר, והוא גם אחד המחברים.
Ancient Noncoding Elements Conserved in the Human Genome Byrappa Venkatesh,1* Ewen F. Kirkness,2* Yong-Hwee Loh,1 Aaron L. Halpern,3 Alison P. Lee,1 Justin Johnson,3 Nidhi Dandona,1 Lakshmi D. Viswanathan,3 Alice Tay,1 J. Craig Venter,3 Robert L. Strausberg,3 Sydney Brenner1 Cartilaginous fishes represent the living group of jawed vertebrates that diverged from the common ancestor of human and teleost fish lineages about 530 million years ago. We generated ~1.4x genome sequence coverage for a cartilaginous fish, the elephant shark (Callorhinchus milii), and compared this genome with the human genome to identify conserved noncoding elements (CNEs). The elephant shark sequence revealed twice as many CNEs as were identified by whole-genome comparisons between teleost fishes and human. The ancient vertebrate-specific CNEs in the elephant shark and human genomes are likely to play key regulatory roles in vertebrate gene expression. 1 Institute of Molecular and Cell Biology, 61 Biopolis Drive, Singapore 138673. 2 Institute for Genomic Research, 9712 Medical Center Drive, Rockville, MD 20850, USA. 3 J. Craig Venter Institute, 9704 Medical Center Drive, Rockville, MD 20850, USA.​
 
M

m0sh3

New member
מתוך (1):

I had visited Tulane University where Reemtsma and his associates4 had transplanted several chimpanzee kidneys with a surprising degree of success. And I had bought four large chimpanzees to use as kidney donors when no human organs were available. The Operation In brief, on January 23, 1964, a potential recipient patient became terminal from years of hypertensive cardiac failure. No human donor heart was available, and so the heart of our largest chimpanzee was transplanted...The donor (chimpanzee) heart proved to be too small for the large male recipient, and the metabolic deterioration of the recipient in his state of intermittent shock over several days was doubtless a major factor. מתוך (2): When a pig organ is transplanted into a primate, hyperacute rejection, induced by anti-pig antibody and mediated by complement and the coagulation system, develops rapidly. This immediate problem can now be overcome, but the return or persistence of anti-pig antibody leads to a delayed form of humoral rejection, acute humoral xenograft rejection, which leads to destruction of the organ within days or weeks.We review the various approaches being investigated to overcome this barrier. Whether they will also prevent subsequent acute cellular rejection remains unknown. Brief mention is made of the potential physiologic incompatibilities between pig and human organs, as well as the microbiologic safety aspects of xenotransplantation. Although, from an immunologic perspective, nonhuman primateswould be preferable sources of organs for humans, virtually all of these species are either endangered or are too small to provide organs suitable for transplantation into large adult humans. Furthermore, concerns have been raised about the transmission of infectious agents from nonhuman primates to humans, particularly since most nonhuman primates are either wild-caught or have been housed under colony conditions for relatively few generations. The time and expense of breeding these animals in captivity are also prohibitive, as is a lack of experience in genetically modifying them. 1. Proceedings of the XVIIth World Congress of the Transplantation Society The first lung transplant in man (1963) and the first heart transplant in man (1964) 2. Annual Review of Medicine Vol. 53: 133-147 WILL THE PIG SOLVE THE TRANSPLANTATION BACKLOG? בריאתנים. פחחח.
 
S

SilentMike

New member
אני מצמיד לשמאל:

אני מצמיד לשמאל למען הקריאות מתוך (1)
success. And I had bought four large chimpanzees to use as kidney donors when no human organs were available. The Operation In brief, on January 23, 1964, a potential recipient patient became terminal from years of hypertensive cardiac failure. No human donor heart was available, and so the heart of our largest chimpanzee was transplanted...The donor (chimpanzee) heart proved to be too small for the large male recipient, and the metabolic deterioration of the recipient in his state of intermittent shock over several days was doubtless a major factor.​
מתוך (2):
When a pig organ is transplanted into a primate, hyperacute rejection, induced by anti-pig antibody and mediated by complement and the coagulation system, develops rapidly. This immediate problem can now be overcome, but the return or persistence of anti-pig antibody leads to a delayed form of humoral rejection, acute humoral xenograft rejection, which leads to destruction of the organ within days or weeks.We review the various approaches being investigated to overcome this barrier. Whether they will also prevent subsequent acute cellular rejection remains unknown. Brief mention is made of the potential physiologic incompatibilities between pig and human organs, as well as the microbiologic safety aspects of xenotransplantation. Although, from an immunologic perspective, nonhuman primateswould be preferable sources of organs for humans, virtually all of these species are either endangered or are too small to provide organs suitable for transplantation into large adult humans. Furthermore, concerns have been raised about the transmission of infectious agents from nonhuman primates to humans, particularly since most nonhuman primates are either wild-caught or have been housed under colony conditions for relatively few generations. The time and expense of breeding these animals in captivity are also prohibitive, as is a lack of experience in genetically modifying them. 1. Proceedings of the XVIIth World Congress of the Transplantation Society The first lung transplant in man (1963) and the first heart transplant in man (1964) 2. Annual Review of Medicine Vol. 53: 133-147 WILL THE PIG SOLVE THE TRANSPLANTATION BACKLOG?​
 
C

C H 4

New member
אתה יכול להגדיר בבקשה

"השכלה ביולוגית והיא מדענית פעילה" אני מכירה מסטרנטים (אולי אפילו דוקטורנטים) שמכחישים את האבולוציה ותורמים לאפרת
אבל קודם כל, לפחות במקרה אחד, אמנם נחצה כבר הגבול של חזרה בתשובה אבל בהתחלה היתה לה חזות חילונית לגמרי. דבר שני, הרבה מסטרנטים וגם כמה דוקטורנטים עושים את הדרך יותר בשביל התעשיה ופחות בשביל המחקר והרבה עוסקים בביוטכנולוגיה ופחות במחקר בסיסי. זה לא אומר שכל ביוטכנולוג או לא בקטע של ביולוגיה מחקרית הוא בריאתן, אבל זה אומר שלא כל מי שלומד ביולוגיה הוא גם בעל זיקה חזקה לתחום ומתחבר להכל. אני חושבת שאם תספר לנו על מישהי שעוסקת במחקר כבר 15-20 שנים (כלומר שיש לה מעבדה משלה) ומעלה את הטיעונים הללו זה קצת אחרת מאשר מסטרנטית או דוקטורנטית שיכולה להסביר את הטענות הבריאתניות בשפה יותר מקצועית. מעולם לא שמעתי על הדברים הללו של דמיון לכריש. להפך, עד כמה שידוע לי ישנם רצפי Alu שקיימים באדם ואאל"ט בחלק מהפרימאטים ובשום בעל חיים אחר, כלומר מעבר להומולוגיה הרצינית בגנים, יש גם הומולוגיה כלשהי בג'אנק DNA בין קופי אדם לאנשים. וזה בלי להתיחס לדמיון המורפולוגי של איברים פנימיים, סוגי דם דומים וכו'.
 
M

m0sh3

New member
מאפיינים*

וגם מערכת הדם ABO עד כמה שידוע לי.
 
C

C H 4

New member
אתה יודע אילו פרימאטים?

ההסתייגות שלי נבעה מכך שבילבלו אותי נורא עם העניין במהלך הלימודים. מרצה אחד טען בתוקף שALU קיימים רק בבני אדם לדעתי שניים אחרים הזכירו אותם גם בהקשר של שימפנזות מה באמת נכון?
 
M

m0sh3

New member
גיל אסט אמר אצלינו בהרצאות שזה מאפיין פרימטים

הוא לא היה ספציפי אז הנחתי שזה מאפיין את כולם. אני אנסה לחפש על זה..
 
M

m0sh3

New member
סקירה מnature של הנושא

מתוך הסקירה(1): The origin and amplification of Alu elements are evolutionarily recent events that coincided with the radiation of primates in the past 65 million years. אני משער שזה תקף לכל הפרימטים, יש שם גם עץ אבולוציוני בסקירה ולמרות שלא קראתי הכל נראה שזה משותף לכולם. 1. Nat Rev Genet. 2002 May;3(5):370-9. Alu repeats and human genomic diversity. http://batzerlab.lsu.edu/Publications/Batzer%20and%20Deininger%202002%20Nature%20Reviews%20Genetics.pdf
 
E

Escherichia Coli

New member
פרימטים ב65 מיליון שנים האחרונות??

מתי הם רק התחילו להופיע? אאל"ט היו מעט אם בכלל יונקים גדולים בתקופה הזו בגלל שהדינוזאורים שלטו ביד רמה בכדור-הארץ. כמו כן, אני די בטוח שהקופים (new and old) התפצלו מאיתנו ב20 מיליון שנים האחרונות (אני לא זוכר מספר יותר מדויק) - אבל אני תוהה איזה פרימטים היו קיימים לפני כל כך הרבה זמן.
 
M

m0sh3

New member
לא קראתי את כל המאמר,

אבל כנראה שמדובר באב הקדמון המשותף לפרימטים וזה היה כנראה די מזמן..
 
You must log in or register to reply here.

Copyright©1996-2021,Tapuz Media Ltd. Forum software by XenForo® © 2010-2020 XenForo Ltd.

למעלה